Exploring the potential intracellular targets of vascular normalization based on active candidates

Article abstract of DOI:10.1016/j.bioorg.2020.104551

We previously developed two candidates with potency of inducing vascular normalization, BD7 and B14. However, the definite intracellular molecular target(s) responsible for their activity remains unknown. Herein, we report the discovery and functional assessment of several multifunctional photoaffinity probes for determining the potential biological targets of active compounds. The probes bear a photoaffinity moiety and a bioorthogonal unit attached to B7 or B14 and maintained the bioactivity of the parent active molecules. Using in vitro biological assays, we preliminarily identified VEGFR-2 as a potential intracellular target for the active candidates. Our results demonstrate the utility of these multifunctional photoaffinity probes for analyzing the biological activity and subcellular localization of the intracellular target proteins of active candidates.

Full text of DOI:10.1016/j.bioorg.2020.104551

Journal Pre-proofs
Short communication
Exploring the potential intracellular targets of vascular normalization based
on active candidates
Yuanyuan Shan, Jin Wang, Ru Si, Yuexiang Ma, Jing Li, Qingqing Zhang,
Wen Lu, Jie Zhang
PII:
S0045-2068(20)31849-6
DOI:
https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2020.104551
YBIOO 104551
Reference:
To appear in:
Bioorganic Chemistry
Received Date:
Revised Date:
Accepted Date:
2 August 2020
8 December 2020
8 December 2020
Please cite this article as: Y. Shan, J. Wang, R. Si, Y. Ma, J. Li, Q. Zhang, W. Lu, J. Zhang, Exploring the
potential intracellular targets of vascular normalization based on active candidates, Bioorganic Chemistry (2020),
doi: https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2020.104551
This is a PDF file of an article that has undergone enhancements after acceptance, such as the addition of a cover
page and metadata, and formatting for readability, but it is not yet the definitive version of record. This version
will undergo additional copyediting, typesetting and review before it is published in its final form, but we are
providing this version to give early visibility of the article. Please note that, during the production process, errors
may be discovered which could affect the content, and all legal disclaimers that apply to the journal pertain.
©
2020 Elsevier Inc. All rights reserved.

Curabitur varius est id magna facilisis, in suscipit tellus auctor. Donec suscipit sed ligula id condimentum. Cras ultrices
nisl non nisl interdum, at tincidunt ante tempor. Sed vitae elit quam. Mauris eget vehicula ligula, id sollicitudin ante.
Nullam semper venenatis sollicitudin. Etiam sem enim, rhoncus at lobortis vel, mattis et mauris. Ut posuere nisi ac lacus
pulvinar mollis.
Sed luctus aliquet ligula. Sed gravida fringilla quam ac fermentum. Duis molestie maximus ultrices. Ut non sodales orci.
Morbi facilisis mattis ex, sollicitudin feugiat augue malesuada sit amet. Praesent ornare ligula ut est mollis, sit amet
sagittis urna faucibus. Vestibulum ante ipsum primis in faucibus orci luctus et ultrices posuere cubilia curae; Donec laoreet,
massa sit amet condimentum volutpat, odio lorem tempus dui, sit amet aliquet felis sem id lectus.
Proin eget ante in diam maximus semper. Morbi tristique faucibus mattis. Ut sit amet tortor iaculis, mollis erat at, tincidunt
justo. Nunc et efficitur eros, et pulvinar est. Donec urna risus, lacinia sollicitudin dui faucibus, aliquet eleifend nunc. Nunc
mollis arcu vitae odio bibendum, ac vestibulum lorem pharetra. Morbi porta enim ornare, consequat ligula id, elementum
eros. Proin lacinia dapibus sollicitudin.
Vestibulum metus tellus, lobortis non dictum ac, dignissim at mauris. Ut ornare, diam quis fermentum finibus, eros lacus
tristique orci, ut molestie lectus justo ut odio. Vivamus egestas enim turpis. Aenean tempor malesuada odio non ornare.
Suspendisse scelerisque leo urna, convallis tristique ligula commodo vel. Quisque lectus augue, interdum at viverra vitae,
bibendum nec leo. Duis id rhoncus felis
Vestibulum metus tellus, lobortis non dictum ac, dignissim at mauris. Ut ornare, diam quis fermentum finibus, eros lacus
tristique orci, ut molestie lectus justo ut odio. Vivamus egestas enim turpis. Aenean tempor malesuada odio non ornare.
Suspendisse scelerisque leo urna, convallis tristique ligula commodo vel. Quisque lectus augue, interdum at viverra vitae,
bibendum nec leo. Duis id rhoncus felis
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551

Sed luctus aliquet ligula. Sed gravida fringilla quam ac fermentum. Duis molestie maximus ultrices. Ut non sodales orci.
Morbi facilisis mattis ex, sollicitudin feugiat augue malesuada sit amet. Praesent ornare ligula ut est mollis, sit amet
sagittis urna faucibus. Vestibulum ante ipsum primis in faucibus orci luctus et ultrices posuere cubilia curae; Donec laoreet,
massa sit amet condimentum volutpat, odio lorem tempus dui, sit amet aliquet felis sem id lectus.
Sed ut perspiciatis unde omnis iste natus error sit voluptatem accusantium doloremque laudantium, totam rem aperiam,
eaque ipsa quae ab illo inventore veritatis et quasi architecto beatae vitae dicta sunt explicabo. Nemo enim ipsam
voluptatem quia voluptas sit aspernatur aut odit aut fugit, sed quia consequuntur magni dolores eos qui ratione voluptatem
sequi nesciunt. Neque porro quisquam est, qui dolorem ipsum quia dolor sit amet, consectetur
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Aliquam tempor aliquet risus, nec auctor ante ultrices vel. Nam
rutrum justo quis magna ornare, non lobortis purus faucibus. In hac habitasse platea dictumst. Vivamus imperdiet est vel
massa fringilla fringilla. Curabitur eros nulla, ornare quis sollicitudin ac, accumsan in tellus. Mauris tempus efficitur mi et
scelerisque. Duis diam arcu, facilisis vel eleifend vitae, congue eu nulla
Etiam venenatis non libero at lacinia. Sed vitae lacinia justo. Vestibulum rutrum porta lacus, nec vestibulum enim fringilla
id. Curabitur nunc risus, egestas vel nunc in, vestibulum scelerisque enim. Cras aliquet euismod magna. Maecenas viverra
neque quam, vitae fringilla augue dignissim sed. Phasellus nisl sapien, iaculis sed lobortis vitae, tristique tincidunt neque.
Aliquam ac blandit risus.
Etiam venenatis non libero at lacinia. Sed vitae lacinia justo. Vestibulum rutrum porta lacus, nec vestibulum enim fringilla
id. Curabitur nunc risus, egestas vel nunc in, vestibulum scelerisque enim. Cras aliquet euismod magna. Maecenas viverra
neque quam, vitae fringilla augue dignissim sed. Phasellus nisl sapien, iaculis sed lobortis vitae, tristique tincidunt neque.
Aliquam ac blandit risus.
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551

At vero eos et accusamus et iusto odio dignissimos ducimus qui blanditiis praesentium voluptatum deleniti atque corrupti
quos dolores et quas molestias excepturi sint occaecati cupiditate non provident, similique sunt in culpa qui officia
deserunt mollitia animi, id est laborum et dolorum fuga. Et harum quidem rerum facilis est et expedita distinctio. Nam
libero tempore, cum soluta nobis est eligendi optio cumque nihil impedit quo minus id quod
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna
aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis
aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat
cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.
Pellentesque rhoncus tempor nisl, at porttitor ipsum suscipit quis. Proin mattis, urna id ultricies volutpat, augue dui
scelerisque purus, et tristique libero justo sed quam. Class aptent taciti sociosqu ad litora torquent per conubia nostra, per
inceptos himenaeos. Pellentesque habitant morbi tristique senectus et netus et malesuada fames ac turpis egestas.
Vestibulum ipsum arcu, cursus nec commodo eget, egestas vel dui. Donec vulputate nec orci
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Aliquam tempor aliquet risus, nec auctor ante ultrices vel. Nam
rutrum justo quis magna ornare, non lobortis purus faucibus. In hac habitasse platea dictumst. Vivamus imperdiet est vel
massa fringilla fringilla. Curabitur eros nulla, ornare quis sollicitudin ac, accumsan in tellus. Mauris tempus efficitur mi et
scelerisque. Duis diam arcu, facilisis vel eleifend vitae, congue eu nulla
Maecenas sodales semper euismod. Nam non suscipit enim. Donec id lorem at est suscipit posuere. Etiam tincidunt nisi
eget leo faucibus porta. Sed congue magna in dignissim tristique. Morbi sodales, enim quis scelerisque congue, risus nisi
venenatis dolor, ut finibus magna augue vel elit. Integer nec mauris nec ligula elementum dictum. Nullam semper luctus
justo, eget tincidunt metus eleifend id. Nunc semper non leo et eleifend
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551

Etiam dapibus tincidunt pulvinar. Cras lorem felis, mattis sodales congue sed, semper eu lorem. Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Proin faucibus est dictum, pulvinar dui vitae, elementum leo. Maecenas elementum
consequat nisl ut feugiat. Morbi dignissim ex vitae malesuada imperdiet. In blandit, arcu at finibus egestas, neque nisi
egestas diam, et fringilla orci est ut ligula. Pellentesque habitant morbi tristique senectus et
Cras metus lectus, pellentesque ullamcorper bibendum a, interdum non ligula. In ultrices sodales iaculis. Ut ipsum felis,
eleifend non nunc ut, pharetra molestie ex. In volutpat ante ex. Suspendisse bibendum tortor a lectus consectetur
scelerisque. Ut ut lacus dui. Ut non molestie velit. Sed efficitur enim in venenatis tristique. Mauris pulvinar libero quis
faucibus consectetur.
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Ut vulputate augue eget odio placerat, in consectetur orci tincidunt.
In hac habitasse platea dictumst. Aliquam efficitur metus ligula, sit amet vehicula ligula rutrum ut. Duis mollis nibh
fringilla lacus maximus, vitae lobortis metus volutpat. Suspendisse ut sapien erat. Pellentesque commodo nulla vitae
facilisis dignissim. Vivamus at orci mi. Donec tristique rhoncus elit ac dapibus.
Sed ut perspiciatis unde omnis iste natus error sit voluptatem accusantium doloremque laudantium, totam rem aperiam,
eaque ipsa quae ab illo inventore veritatis et quasi architecto beatae vitae dicta sunt explicabo. Nemo enim ipsam
voluptatem quia voluptas sit aspernatur aut odit aut fugit, sed quia consequuntur magni dolores eos qui ratione voluptatem
sequi nesciunt. Neque porro quisquam est, qui dolorem ipsum quia dolor sit amet, consectetur
Vestibulum metus tellus, lobortis non dictum ac, dignissim at mauris. Ut ornare, diam quis fermentum finibus, eros lacus
tristique orci, ut molestie lectus justo ut odio. Vivamus egestas enim turpis. Aenean tempor malesuada odio non ornare.
Suspendisse scelerisque leo urna, convallis tristique ligula commodo vel. Quisque lectus augue, interdum at viverra vitae,
bibendum nec leo. Duis id rhoncus felis
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Ut vulputate augue eget odio placerat, in consectetur orci tincidunt.
In hac habitasse platea dictumst. Aliquam efficitur metus ligula, sit amet vehicula ligula rutrum ut. Duis mollis nibh
fringilla lacus maximus, vitae lobortis metus volutpat. Suspendisse ut sapien erat. Pellentesque commodo nulla vitae
facilisis dignissim. Vivamus at orci mi. Donec tristique rhoncus elit ac dapibus.
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Ut vulputate augue eget odio placerat, in consectetur orci tincidunt.
In hac habitasse platea dictumst. Aliquam efficitur metus ligula, sit amet vehicula ligula rutrum ut. Duis mollis nibh
fringilla lacus maximus, vitae lobortis metus volutpat. Suspendisse ut sapien erat. Pellentesque commodo nulla vitae
facilisis dignissim. Vivamus at orci mi. Donec tristique rhoncus elit ac dapibus.
Sed luctus aliquet ligula. Sed gravida fringilla quam ac fermentum. Duis molestie maximus ultrices. Ut non sodales orci.
Morbi facilisis mattis ex, sollicitudin feugiat augue malesuada sit amet. Praesent ornare ligula ut est mollis, sit amet
sagittis urna faucibus. Vestibulum ante ipsum primis in faucibus orci luctus et ultrices posuere cubilia curae; Donec laoreet,
massa sit amet condimentum volutpat, odio lorem tempus dui, sit amet aliquet felis sem id lectus.
Aliquam faucibus maximus augue vitae molestie. Vivamus a odio ullamcorper, hendrerit nisi a, condimentum lectus.
Phasellus elementum, mauris id consequat fermentum, lorem lectus vehicula elit, in tempor nunc libero et nisl. Interdum et
malesuada fames ac ante ipsum primis in faucibus. Praesent ac nibh libero. Nunc tristique ac erat vitae scelerisque. Donec
ultricies suscipit enim, molestie convallis dui iaculis sed.
Morbi ac scelerisque magna. Integer imperdiet ligula sit amet est vestibulum dapibus. Sed facilisis et tellus sed dictum.
Quisque non maximus augue. Etiam euismod semper diam, interdum ultrices velit. Vivamus nulla enim, convallis vel leo
sit amet, efficitur maximus est. Nullam eu lacinia metus, a hendrerit mauris. Sed eu pulvinar lorem. Sed augue leo, facilisis
at eros quis, convallis sagittis ex. Donec ut tempor lectus, eu cursus est. Vivamus
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551

Etiam dapibus tincidunt pulvinar. Cras lorem felis, mattis sodales congue sed, semper eu lorem. Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Proin faucibus est dictum, pulvinar dui vitae, elementum leo. Maecenas elementum
consequat nisl ut feugiat. Morbi dignissim ex vitae malesuada imperdiet. In blandit, arcu at finibus egestas, neque nisi
egestas diam, et fringilla orci est ut ligula. Pellentesque habitant morbi tristique senectus et
Vestibulum metus tellus, lobortis non dictum ac, dignissim at mauris. Ut ornare, diam quis fermentum finibus, eros lacus
tristique orci, ut molestie lectus justo ut odio. Vivamus egestas enim turpis. Aenean tempor malesuada odio non ornare.
Suspendisse scelerisque leo urna, convallis tristique ligula commodo vel. Quisque lectus augue, interdum at viverra vitae,
bibendum nec leo. Duis id rhoncus felis
At vero eos et accusamus et iusto odio dignissimos ducimus qui blanditiis praesentium voluptatum deleniti atque corrupti
quos dolores et quas molestias excepturi sint occaecati cupiditate non provident, similique sunt in culpa qui officia
deserunt mollitia animi, id est laborum et dolorum fuga. Et harum quidem rerum facilis est et expedita distinctio. Nam
libero tempore, cum soluta nobis est eligendi optio cumque nihil impedit quo minus id quod
Quisque et risus posuere, hendrerit libero in, vulputate massa. Vestibulum accumsan felis a odio rhoncus consequat. Morbi
consectetur eu ante sit amet molestie. Integer eu massa eget orci placerat volutpat vitae non nulla. Maecenas dapibus lacus
vitae vehicula tristique. Morbi a venenatis nisi. Ut imperdiet felis non neque feugiat consectetur nec id nisi. Cras ut
elementum nulla. Maecenas et posuere diam.
Sed nunc nisi, egestas sit amet commodo ac, scelerisque at justo. Curabitur ultricies ligula nec massa tempus, vitae
placerat ante hendrerit. Duis orci augue, rutrum eget libero nec, porta feugiat libero. In lacinia venenatis finibus. Nunc
eleifend nisi faucibus dui maximus, id sagittis lacus laoreet. Aliquam imperdiet arcu id turpis molestie tempor. Phasellus
orci urna, vestibulum non mattis vitae, cursus at velit. Mauris consequat tellus ac mi volutpat laoreet.
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551

Vestibulum metus tellus, lobortis non dictum ac, dignissim at mauris. Ut ornare, diam quis fermentum finibus, eros lacus
tristique orci, ut molestie lectus justo ut odio. Vivamus egestas enim turpis. Aenean tempor malesuada odio non ornare.
Suspendisse scelerisque leo urna, convallis tristique ligula commodo vel. Quisque lectus augue, interdum at viverra vitae,
bibendum nec leo. Duis id rhoncus felis
Maecenas sodales semper euismod. Nam non suscipit enim. Donec id lorem at est suscipit posuere. Etiam tincidunt nisi
eget leo faucibus porta. Sed congue magna in dignissim tristique. Morbi sodales, enim quis scelerisque congue, risus nisi
venenatis dolor, ut finibus magna augue vel elit. Integer nec mauris nec ligula elementum dictum. Nullam semper luctus
justo, eget tincidunt metus eleifend id. Nunc semper non leo et eleifend
Etiam dapibus tincidunt pulvinar. Cras lorem felis, mattis sodales congue sed, semper eu lorem. Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Proin faucibus est dictum, pulvinar dui vitae, elementum leo. Maecenas elementum
consequat nisl ut feugiat. Morbi dignissim ex vitae malesuada imperdiet. In blandit, arcu at finibus egestas, neque nisi
egestas diam, et fringilla orci est ut ligula. Pellentesque habitant morbi tristique senectus et
Aliquam faucibus maximus augue vitae molestie. Vivamus a odio ullamcorper, hendrerit nisi a, condimentum lectus.
Phasellus elementum, mauris id consequat fermentum, lorem lectus vehicula elit, in tempor nunc libero et nisl. Interdum et
malesuada fames ac ante ipsum primis in faucibus. Praesent ac nibh libero. Nunc tristique ac erat vitae scelerisque. Donec
ultricies suscipit enim, molestie convallis dui iaculis sed.
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Aliquam tempor aliquet risus, nec auctor ante ultrices vel. Nam
rutrum justo quis magna ornare, non lobortis purus faucibus. In hac habitasse platea dictumst. Vivamus imperdiet est vel
massa fringilla fringilla. Curabitur eros nulla, ornare quis sollicitudin ac, accumsan in tellus. Mauris tempus efficitur mi et
scelerisque. Duis diam arcu, facilisis vel eleifend vitae, congue eu nulla
Bioorganic Chemistry, Journal Pre-proof, 104551. doi:10.1016/j.bioorg.2020.104551