Structure and Function of M. tuberculosis CYP142
Kolonay, J. F., Nelson, W. C., Umayam, L. A., Ermolaeva, M., Salzberg,
S. L., Delcher, A., Utterback, T., Weidman, J., Khouri, H., Gill, J., Mikula,
A., Bishai, W., Jacobs, W. R., Jr., Venter, J. C., and Fraser, C. M. (2002) J.
Bacteriol. 184, 5479–5490
Bjorkhem, I., and Pikuleva, I. A. (2003) Biochemistry 42, 14284–14292
36. Kabsch, W. (1993) J. Appl. Crystallogr. 26, 795–800
37. Collaborative Computation Project No. 4 (1994) Acta Crystallogr. D
Biol. Crystallogr. 50, 760–763
13. McLean, K. J., Scrutton, N. S., and Munro, A. W. (2003) Biochem. J. 372,
317–327
38. McCoy, A. J., Grosse-Kunstleve, R. W., Adams, P. D., Winn, M. D., Sto-
roni, L. C., and Read, R. J. (2007) J. Appl. Crystallogr. 40, 658–674
39. Emsley, P., and Cowtan, K. (2004) Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr.
60, 2126–2132
14. Bellamine, A., Mangla, A. T., Nes, W. D., and Waterman, M. R. (1999)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96, 8937–8942
15. Belin, P., Le Du, M. H., Fielding, A., Lequin, O., Jacquet, M., Charbon-
nier, J. B., Lecoq, A., Thai, R., Courc¸on, M., Masson, C., Dugave, C.,
Genet, R., Pernodet, J. L., and Gondry, M. (2009) Proc. Natl. Acad. Sci.
U.S.A. 106, 7426–7431
40. Davis, I. W., Leaver-Fay, A., Chen, V. B., Block, J. N., Kapral, G. J., Wang,
X., Murray, L. W., Arendall, W. B., 3rd, Snoeyink, J., Richardson, J. S.,
and Richardson, D. C. (2007) Nucleic Acids Res. 35, W375–W383
41. Adams, P. D., Afonine, P. V., Bunko´czi, G., Chen, V. B., Davis, I. W.,
Echols, N., Headd, J. J., Hung, L. W., Kapral, G. J., Grosse-Kunstleve,
R. W., McCoy, A. J., Moriarty, N. W., Oeffner, R., Read, R. J., Richard-
son, D. C., Richardson, J. S., Terwilliger, T. C., and Zwart, P. H. (2010)
Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 66, 213–221
16. Holsclaw, C. M., Sogi, K. M., Gilmore, S. A., Schelle, M. W., Leavell,
M. D., Bertozzi, C. R., and Leary, J. A. (2008) ACS Chem. Biol. 3,
619–624
17. Johnston, J. B., Kells, P. M., Podust, L. M., and Ortiz de Montellano, P. R.
(2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 20687–20692
18. McLean, K. J., Lafite, P., Levy, C., Cheesman, M. R., Mast, N., Pikuleva,
I. A., Leys, D., and Munro, A. W. (2009) J. Biol. Chem. 284,
35524–35533
42. Lafite, P., Andre´, F., Zeldin, D. C., Dansette, P. M., and Mansuy, D.
(2007) Biochemistry 46, 10237–10247
43. Perera, R., Sono, M., Sigman, J. A., Pfister, T. D., Lu, Y., and Dawson,
J. H. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100, 3641–3646
44. Dunford, A. J., McLean, K. J., Sabri, M., Seward, H. E., Heyes, D. J.,
Scrutton, N. S., and Munro, A. W. (2007) J. Biol. Chem. 282,
24816–24824
19. Capyk, J. K., Kalscheuer, R., Stewart, G. R., Liu, J., Kwon, H., Zhao, R.,
Okamoto, S., Jacobs, W. R., Jr., Eltis, L. D., and Mohn, W. W. (2009)
J. Biol. Chem. 284, 35534–35542
20. Van der Geize, R., Yam, K., Heuser, T., Wilbrink, M. H., Hara, H.,
Anderton, M. C., Sim, E., Dijkhuizen, L., Davies, J. E., Mohn, W. W., and
Eltis, L. D. (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104, 1947–1952
21. Chang, J. C., Harik, N. S., Liao, R. P., and Sherman, D. R. (2007) J. Infect.
Dis. 196, 788–795
45. Aoyama, Y., Horiuchi, T., Gotoh, O., Noshiro, M., and Yoshida, Y.
(1998) J. Biochem. 124, 694–696
46. McLean, K. J., Warman, A. J., Seward, H. E., Marshall, K. R., Girvan,
H. M., Cheesman, M. R., Waterman, M. R., and Munro, A. W. (2006)
Biochemistry 45, 8427–8443
22. Chang, J. C., Miner, M. D., Pandey, A. K., Gill, W. P., Harik, N. S., Sas-
setti, C. M., and Sherman, D. R. (2009) J. Bacteriol. 191, 5232–5239
23. McLean, K. J., Belcher, J., Driscoll, M. D., Fernandez, C., Le Van, D., Bui,
S., Golovanova, M., and Munro, A. W. (2010) Future Med. Chem. 2,
1339–1353
47. Ogura, H., Nishida, C. R., Hoch, U. R., Perera, R., Dawson, J. H., and Or-
tiz de Montellano, P. R. (2004) Biochemistry 43, 14712–14721
48. Girvan, H. M., Levy, C. W., Williams, P., Fisher, K., Cheesman, M. R.,
Rigby, S. E., Leys, D., and Munro, A. W. (2010) Biochem. J. 427,
455–466
24. Ouellet, H., Lang, J., Couture, M., and Ortiz de Montellano, P. R. (2009)
Biochemistry 48, 863–872
49. Rosłoniec, K. Z., Wilbrink, M. H., Capyk, J. K., Mohn, W. W., Ostendorf,
M., van der Geize, R., Dijkhuizen, L., and Eltis, L. D. (2009) Mol. Micro-
biol. 74, 1031–1043
25. Ouellet, H., Guan, S., Johnston, J. B., Chow, E. D., Kells, P. M., Burl-
ingame, A. L., Cox, J. S., Podust, L. M., and de Montellano, P. R. (2010)
Mol. Microbiol. 77, 730–742
50. Jain, M., Petzold, C. J., Schelle, M. W., Leavell, M. D., Mougous, J. D.,
Bertozzi, C. R., Leary, J. A., and Cox, J. S. (2007) Proc. Natl. Acad. Sci.
U.S.A. 104, 5133–5138
26. McLean, K. J., Cheesman, M. R., Rivers, S. L., Richmond, A., Leys, D.,
Chapman, S. K., Reid, G. A., Price, N. C., Kelly, S. M., Clarkson, J., Smith,
W. E., and Munro, A. W. (2002) J. Inorg. Biochem. 91, 527–541
27. Leys, D., Mowat, C. G., McLean, K. J., Richmond, A., Chapman, S. K.,
Walkinshaw, M. D., and Munro, A. W. (2003) J. Biol. Chem. 278,
5141–5147
51. Capyk, J. K., D’Angelo, I., Strynadka, N. C., and Eltis, L. D. (2009) J. Biol.
Chem. 284, 9937–9946
52. Stombaugh, N. A., Sundquist, J. E., Burris, R. H., and Orme-Johnson,
W. H. (1976) Biochemistry 15, 2633–2641
53. Batie, C. J., and Kamin, H. (1981) J. Biol. Chem. 256, 7756–7763
54. McIver, L., Leadbeater, C., Campopiano, D. J., Baxter, R. L., Daff, S. N.,
Chapman, S. K., and Munro, A. W. (1998) Eur. J. Biochem. 257, 577–585
55. DuSell, C. D., Umetani, M., Shaul, P. W., Mangelsdorf, D. J., and Mc-
Donnell, D. P. (2008) Mol. Endocrinol. 22, 65–77
28. McLean, K. J., Carroll, P., Lewis, D. G., Dunford, A. J., Seward, H. E.,
Neeli, R., Cheesman, M. R., Marsollier, L., Douglas, P., Smith, W. E.,
Rosenkrands, I., Cole, S. T., Leys, D., Parish, T., and Munro, A. W.
(2008) J. Biol. Chem. 283, 33406–33416
29. Morrison, J. F. (1969) Biochim. Biophys. Acta 185, 269–286
30. Omura, T., and Sato, R. (1964) J. Biol. Chem. 239, 2370–2378
31. Berry, E. A., and Trumpower, B. L. (1987) Anal. Biochem. 161, 1–15
32. Daff, S. N., Chapman, S. K., Turner, K. L., Holt, R. A., Govindaraj, S.,
Poulos, T. L., and Munro, A. W. (1997) Biochemistry 36, 13816–13823
33. Girvan, H. M., Marshall, K. R., Lawson, R. J., Leys, D., Joyce, M. G.,
Clarkson, J., Smith, W. E., Cheesman, M. R., and Munro, A. W. (2004)
J. Biol. Chem. 279, 23274–23286
56. Hansson, M., Ellis, E., Hunt, M. C., Schmitz, G., and Babiker, A. (2003)
Biochim. Biophys. Acta 1593, 283–289
57. Chen, W., Chen, G., Head, D. L., Mangelsdorf, D. J., and Russell, D. W.
(2007) Cell Metab. 5, 73–79
58. Javitt, N. B. (2002) J. Lipid Res. 43, 665–670
59. McLean, K. J., Clift, D., Lewis, D. G., Sabri, M., Balding, P. R., Sutcliffe,
M. J., Leys, D., and Munro, A. W. (2006) Trends Microbiol. 14, 220–228
60. Driscoll, M. D., McLean, K. J., Cheesman, M. R., Jowitt, T. A., Howard,
M., Carroll, P., Parish, T., and Munro, A. W. (2010) Biochim. Biophys.
Acta, in press
34. Dutton, P. L. (1978) Methods Enzymol. 54, 411–435
35. Mast, N., Norcross, R., Andersson, U., Shou, M., Nakayama, K.,
38282 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
VOLUME 285•NUMBER 49•DECEMBER 3, 2010