2632
S. S. Bag et al. / Tetrahedron Letters 54 (2013) 2627–2632
Biol. Macromol. 2007, 41, 173; (d) Nafisi, S.; Bonsaii, M.; Maali, P.; Khalilzadeh,
References and notes
M. A.; Manouchehri, F. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 2010, 100, 84.
11. (a) Guan, Y.; Shi, R.; Li, X.; Zhao, M.; Li, Y. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 7336; (b)
Dragan, A. I.; Casas-Finet, J. R.; Bishop, E. S.; Strouse, R. J.; Schenerman, M. A.;
Geddes, C. D. Biophys. J. 2010, 99, 3010.
12. (a) Haq, I.; Ladbury, J. E.; Chowhdry, B. Z.; Jenkins, T. C.; Chaires, J. B. J. Mol. Biol.
1997, 271, 244; (b) Guan, Y.; Shi, R.; Li, X.; Zhao, M.; Li, Y. Phys. Chem. B 2007,
111, 7336; (c) Pal, N.; Verma, S. D.; Sen, S. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9277.
13. (a) Kumar, C. V.; Asuncion, E. H. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 8547; (b) Xu, Z.;
Bai, G.; Dong, C. Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 5694; (c) Saha, I.; Kumar, G. S. J.
Fluoresc. 2011, 21, 247.
14. Maestro, version 9.0, Schrödinger, LLC, New York, NY, 2009.
15. (a) Sahoo, B. K.; Ghosh, K. S.; Dasgupta, S. Biophys. Chem. 2008, 132, 81; (b) Liu,
E.-H.; Qi, L.-W.; Li, P. Molecules 2010, 15, 9092; (c) Banerjee, P.; Ghosh, S.;
Sarkar, A.; Bhattacharya, S. C. J. Luminescence 2011, 131, 316; (d) Roy, D.; Dutta,
S.; Maity, S. S.; Ghosh, S.; Roy, A. S.; Ghosh, K. S.; Dasgupta, S. J. Luminescence
2012, 132, 1364.
16. (a) Hazra, P.; Chakrabarty, D.; Chakraborty, A.; Sarkar, N. Biochem. Biophys. Res.
Commun. 2004, 314, 543; (b) Maity, S. S.; Samanta, S.; Sardar, P. S.; Pal, A.;
Dasgupta, S.; Ghosh, S. Chem. Phys. 2008, 354, 162; (c) Bhattacharya, B.; Nakka,
S.; Guruprasad, L.; Samanta, A. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 2143; (d) Paul, B. K.;
Guchhait, N. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 10322.
17. (a) Michael, C.; Puri, N. K. Biochem. J. 1992, 282, 589; (b) Bigelow, C. C. Channon,
M. In Handbook of Biochemistry and Molecular Biology; Fasman, G. D., Ed.; CRC
Press: Cleveland, 1975; (c) Walker, J. M. The Proteomics Protocols Handbook;
Humana Press: Totowa, NJ, 2005.
18. (a) Jackson, B. A.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1999, 119, 12986; (b) Hart, J. R.;
Glebov, O.; Ernst, R. J.; Kirsch, I. R.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006,
103, 15359; (c) Bag, S. S.; Saito, Y.; Hanawa, K.; Kodate, S.; Suzuka, I.; Saito, I.
Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16, 6338; (d) Zeglis, B. M.; Barton, J. K. Nat. Protoc.
2007, 2, 357; (e) Ernst, R. J.; Song, H.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131,
2359.
19. (a) Yang, X. L.; Hubbard, R. B.; Lee, M.; Tao, Z. F.; Sugiyama, H.; Wang, A. H. J.
Nucleic Acids Res. 1999, 27, 4183; (b) Nakatani, K.; Sando, S.; Kumasawa, H.;
Kikuchi, J.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12650; (c) David, A.; Bleimling,
N.; Beuck, C.; Lehn, J. M.; Weinhold, E.; Teulade-Fichou, M. P. Chembiochem
2003, 4, 1326; (d) Hagihara, S.; Kumasawa, H.; Goto, Y.; Hayashi, G.; Kobori,
A.; Saito, I.; Nakatani, K. Nucleic Acids Res. 2004, 32, 278; (e) Zeglis, B. M.;
Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5654; (f) Pierre, V. C.; Kaiser, J. T.;
Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 429; (g) Bahr, M.; Gabelica,
V.; Granzhan, A.; Teulade-Fichou, M.-P.; Weinhold, E. Nucleic Acids Res. 2008,
36, 5000; (h) Venkatesan, N. Y.; Seo, J.; Kim, B. H. Chem. Soc. Rev. 2008, 37,
648; (i) Bag, S. S.; Kundu, R.; Matsumoto, K.; Saito, Y.; Saito, I. Bioorg. Med.
Chem Lett. 2010, 20, 3227; (j) Sinkeldam, R. W.; Greco, N.; Tor, Y. Chem. Rev.
2010, 110, 2579.
1. (a) Peczuh, M. W.; Hamilton, A. D. Chem. Rev. 2000, 100, 2479; (b) Tse, W. C.;
Boger, D. L. Acc. Chem. Res. 2004, 37, 61; (c) Kurishita, Y.; Kohira, T.; Ojida, A.;
Hamachi, I. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 13290; (d) Wu, J.; Liu, W.; Ge, J.; Zhang,
H.; Wang, P. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 3483; (e) Mandal, S. S.; Kumar, N. V.;
Varshney, U.; Bhattacharya, S. J. Inorg. Biochem. 1996, 63, 265; (f) Bhattacharya,
S.; Mandal, S. S. Biochim. Biophys. Acta Biomembr. 1997, 1323, 29; (g)
Bhattacharya, S.; Thomas, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000, 267, 139;
(h) Chaudhuri, P.; Ganguly, B.; Bhattacharya, S. J. Org. Chem. 2007, 72, 1912.
2. (a) Basak, A.; Bag, S. S.; Basak, A. Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 4096; (b)
Granzhan, A.; Ihmels, H. Org. Lett. 2005, 7, 5119; (c) Wu, F. Y.; Xie, F. Y.; Wu, Y.
M.; Hong, J. I. J. Fluoresc. 2008, 18, 175; (d) Sahoo, D.; Bhattacharya, P.;
Chakravorti, S. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 2044.
3. (a) Suzuki, Y.; Yokoyama, K. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17799; (b) Yuan, C.-X.;
Tao, X.-T.; Wang, L.; Yang, J.-X.; Jiang, M.-H. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 6809; (c)
Xu, Y.; Li, Z.; Malkovskiy, A.; Sun, S.; Pang, Y. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 8574;
(d) Wang, J.-X.; Chen, Q.; Bian, N.; Yang, F.; Sun, J.; Qi, A.-D.; Yan, C.-G.; Han, B.-
H. Org. Biomol. Chem. 2011, 9, 2219; (e) Banerjee, M.; Pal, U.; Subudhhi, A.;
Chakrabarti, A.; Basu, S. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 2012, 108, 23.
4. (a) Krishna, A. G.; Kumar, D. V.; Khan, B. M.; Rawal, S. K.; Ganesh, K. N. Biochim.
Biophy. Acta 1998, 1381, 104; (b) Egawa, Y.; Hayashida, R.; Seki, T.; Anzai, J.
Talanta 2008, 76, 736; (c) Lu, H.; Xu, B.; Dong, Y.; Chen, F.; Li, Y.; Li, Z.; He, J.; Li,
H.; Tian, W. Langmuir 2010, 26, 6838; (d) Gu, X.; Zhang, G.; Zhang, D. Analyst
2012, 137, 365.
5. (a) Bag, S. S.; Kundu, R. J. Org. Chem. 2011, 76, 3348; (b) Bag, S. S.; Kundu, R.;
Talukdar, S. Tetrahedron Lett. 2012, 53, 5875.
6. (a) Luo, J.; Xie, Z.; Lam, J. W. Y.; Cheng, L.; Chen, H.; Qiu, C.; Kwok, H. S.; Zhan,
X.; Liu, Y.; Zhu, D.; Tang, B. Z. Chem. Commun. 2001, 1740; (b) Freemantle, M.
Chem. Eng. News 2001, 79, 29; (c) Chen, J.; Law, C. C. W.; Lam, J. W. Y.; Dong, Y.;
Lo, S. M. F.; Williams, I. D.; Zhu, D.; Tang, B. Z. Chem. Mater. 2003, 15, 1535; (d)
Tong, H.; Hong, Y.; Dong, Y.; Häußler, M.; Lam, J. W. Y.; Li, Z.; Guo, Z.; Guo, Z.;
Tang, B. Z. Chem. Commun. 2006, 3705; (e) Wang, J.; Mei, J.; Hu, R.; Sun, J. Z.;
Qin, A.; Tang, B. Z. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 9956.
7. Winnik, F. M. Chem. Rev. 1993, 93, 587.
8. (a) Ye, B. F.; Zhang, Z. J.; Ju, H. X. Chin. J. Chem. 2005, 23, 58; (b) Sahoo, B. K.;
Ghosh, K. S.; Bera, R.; Dasgupta, S. Chem. Phys. 2008, 351, 163; (c) Bera, R.;
Sahoo, B. K.; Ghosh, K. S.; Dasgupta, S. Int. J. Biol. Macromol. 2008, 42, 14; (d)
Ghosh, R.; Bhowmik, S.; Bagchi, A.; Das, D.; Ghosh, S. Eur. Biophys. J. 2010, 39,
1243.
9. (a) Garland, F.; Graves, D. E.; Yielding, L. W.; Cheungf, H. C. Biochemistry 1980,
19, 3221; (b) Reinhardt, C. G.; Krugh, T. R. Biochemistry 1978, 17, 4845.
10. (a) Bresloff, J. L.; Crothers, D. M. Biochemistry 1981, 20, 3547; (b) Wu, H. L.; Li,
W. Y.; He, X. W.; Miao, K.; Liang, H. Anal. Bioanal. Chem. 2002, 373, 163; (c)
Ghaderi, M.; Bathaie, S. Z.; Saboury, A. A.; Sharghi, H.; Tangestaninejad, S. Int. J.