D. Rodriguez et al. / Bioorg. Med. Chem. 19 (2011) 5446–5453
5453
23. Lad, L.; Luo, L.; Carson, J. D.; Wood, K. W.; Hartman, J. J.; Copeland, R. A.;
Sakowicz, R. Biochemistry 2008, 47, 3576.
24. Nakai, R.; Iida, S.; Takahashi, T.; Tsujita, T.; Okamoto, S.; Takada, C.; Akasaka, K.;
Ichikawa, S.; Ishida, H.; Kusaka, H.; Akinaga, S.; Murakata, C.; Honda, S.; Nitta,
M.; Saya, H.; Yamashita, Y. Cancer Res. 2009, 69, 3901.
25. Brier, S.; Lemaire, D.; Debonis, S.; Forest, E.; Kozielski, F. Biochemistry 2004, 43,
13072.
26. Brier, S.; Lemaire, D.; DeBonis, S.; Kozielski, F.; Forest, E. Rapid Commun. Mass
Spectrom. 2006, 20, 456.
Centre: Cambridge U.K., 2010) and Hermes 1.4.1. Docking was per-
formed in the binding site of PDB code: 2FME. All the water mole-
cules present in the binding site were allowed to be replaced by the
ligand or to change orientation. The standard function Gold score
was used for ranking the poses, including 30 solutions for each li-
gand generated. Ligand Scout v 3.0 (Inte:Ligand GmbH: Vienna,
Austria, 2010) was used for visual inspection of the docked poses
and for producing three-dimensional visual representations.
27. Maliga, Z.; Kapoor, T. M.; Mitchison, T. J. Chem. Biol. 2002, 9, 989.
28. Maliga, Z.; Xing, J.; Cheung, H.; Juszczak, L. J.; Friedman, J. M.; Rosenfeld, S. S. J.
Biol. Chem. 2006, 281, 7977.
Acknowledgments
29. Turner, J.; Anderson, R.; Guo, J.; Beraud, C.; Fletterick, R.; Sakowicz, R. J. Biol.
Chem. 2001, 276, 25496.
30. Cochran, J. C.; Gilbert, S. P. Biochemistry 2005, 44, 16633.
31. Behnke-Parks, W. M.; Vendome, J.; Honig, B.; Maliga, Z.; Moores, C.; Rosenfeld,
S. S. J. Biol. Chem. 2011, 286, 5242.
32. Kim, E. D.; Buckley, R.; Learman, S.; Richard, J.; Parke, C.; Worthylake, D. K.;
Wojcik, E. J.; Walker, R. A.; Kim, S. J. Biol. Chem. 2010, 285, 18650.
33. Beer, T. M.; Goldman, B.; Synold, T. W.; Ryan, C. W.; Vasist, L. S.; Van
Veldhuizen, P. J., Jr.; Dakhil, S. R.; Lara, P. N., Jr.; Drelichman, A.; Hussain, M. H.;
Crawford, E. D. Clin. Genitourin. Cancer 2008, 6, 103.
34. Lee, C. W.; Belanger, K.; Rao, S. C.; Petrella, T. M.; Tozer, R. G.; Wood, L.; Savage,
K. J.; Eisenhauer, E. A.; Synold, T. W.; Wainman, N.; Seymour, L. Invest. New
Drugs 2008, 26, 249.
35. Blagden, S. P.; Molife, L. R.; Seebaran, A.; Payne, M.; Reid, A. H.; Protheroe, A. S.;
Vasist, L. S.; Williams, D. D.; Bowen, C.; Kathman, S. J.; Hodge, J. P.; Dar, M. M.;
de Bono, J. S.; Middleton, M. R. Br. J. Cancer 2008, 98, 894.
36. Kathman, S. J.; Williams, D. H.; Hodge, J. P.; Dar, M. Cancer Chemother.
Pharmacol. 2009, 63, 469.
The authors would like to thank Dr. Kathy Hanley for her assis-
tance in statistical analyses. This work is supported by National
Science Foundation MCB0818729 (CBS), National Center for
Research Resources P20 RR16480 (JBA and CBS), the Howard
Hughes Medical Institute’s Undergraduate Education Improvement
Program at NMSU, the Cowboys for Cancer Research Foundation,
and an Interdisciplinary Research Grant from the NMSU Vice Pres-
ident for Research (JBA and CBS). We acknowledge the NCI Devel-
opmental Therapeutics Program for providing biological data
Supplementary data
37. Knox, J. J.; Gill, S.; Synold, T. W.; Biagi, J. J.; Major, P.; Feld, R.; Cripps, C.;
Wainman, N.; Eisenhauer, E.; Seymour, L. Invest. New Drugs 2008, 26, 265.
38. Tang, P. A.; Siu, L. L.; Chen, E. X.; Hotte, S. J.; Chia, S.; Schwarz, J. K.; Pond, G. R.;
Johnson, C.; Colevas, A. D.; Synold, T. W.; Vasist, L. S.; Winquist, E. Invest. New
Drugs 2008, 26, 257.
Supplementary data associated with this article can be found, in
39. Debonis, S.; Skoufias, D. A.; Indorato, R. L.; Liger, F.; Marquet, B.; Laggner, C.;
Joseph, B.; Kozielski, F. J. Med. Chem. 2008, 51, 1115.
References and notes
40. Ogo, N.; Oishi, S.; Matsuno, K.; Sawada, J.; Fujii, N.; Asai, A. Bioorg. Med. Chem.
Lett. 2007, 17, 3921.
1. Maliga, Z.; Mitchison, T. J. BMC Chem. Biol. 2006, 6, 2.
2. Marshall, C. G.; Torrent, M.; Williams, O.; Hamilton, K. A.; Buser, C. A. Arch.
Biochem. Biophys. 2009, 484, 1.
3. Tcherniuk, S.; van Lis, R.; Kozielski, F.; Skoufias, D. A. Biochem. Pharmacol 2009,
79, 864.
41. Kaan, H. Y.; Weiss, J.; Menger, D.; Ulaganathan, V.; Tkocz, K.; Laggner, C.;
Popowycz, F.; Joseph, B.; Kozielski, F. J. Med. Chem. 2011, 54, 1576.
42. Hapuarachchige, S.; Montano, G.; Ramesh, C.; Rodriguez, D.; Henson, L. H.;
Williams, C. C.; Kadavakkollu, S.; Johnson, D. L.; Shuster, C. B.; Arterburn, J. B. J.
Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6780.
43. Riddoch, R. W.; Schaffer, P.; Valliant, J. F. Bioconjugate Chem. 2006, 17, 226.
44. Funk, C. J.; Davis, A. S.; Hopkins, J. A.; Middleton, K. M. Anal. Biochem. 2004, 329,
68.
45. Cochran, J. C.; Gatial, J. E., 3rd; Kapoor, T. M.; Gilbert, S. P. J. Biol. Chem. 2005,
280, 12658.
46. Kapoor, T. M.; Mayer, T. U.; Coughlin, M. L.; Mitchison, T. J. J. Cell Biol. 2000, 150,
975.
4. Brier, S.; Lemaire, D.; DeBonis, S.; Forest, E.; Kozielski, F. J. Mol. Biol. 2006, 360,
360.
5. Jordan, M. A.; Wilson, L. Nat. Rev. Cancer 2004, 4, 253.
6. Zhou, J.; Giannakakou, P. Curr. Med. Chem. Anticancer Agents 2005, 5, 65.
7. Bergnes, G.; Brejc, K.; Belmont, L. Curr. Top. Med. Chem. 2005, 5, 127.
8. Duhl, D. M.; Renhowe, P. A. Curr. Opin. Drug Discov. Devel. 2005, 8, 431.
9. Huszar, D.; Theoclitou, M. E.; Skolnik, J.; Herbst, R. Cancer Metastasis Rev. 2009,
28, 197.
47. Carol, H.; Lock, R.; Houghton, P. J.; Morton, C. L.; Kolb, E. A.; Gorlick, R.;
Reynolds, C. P.; Maris, J. M.; Keir, S. T.; Billups, C. A.; Smith, M. A. Pediatr. Blood
Cancer 2009, 53, 1255.
48. Palchaudhuri, R.; Nesterenko, V.; Hergenrother, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130,
10274.
49. Casanova, E.; Hernandez, A. I.; Priego, E. M.; Liekens, S.; Camarasa, M. J.;
Balzarini, J.; Perez-Perez, M. J. J. Med. Chem. 2006, 49, 5562.
50. Al-Qawasmeh, R. A.; Lee, Y.; Cao, M. Y.; Gu, X.; Vassilakos, A.; Wright, J. A.;
Young, A. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 347.
51. Benzaquen, L. R.; Brugnara, C.; Byers, H. R.; Gatton-Celli, S.; Halperin, J. A. Nat.
Med. 1995, 1, 534.
52. Khalid, M. H.; Tokunaga, Y.; Caputy, A. J.; Walters, E. J. Neurosurg. 2005, 103, 79.
53. Snajdrova, L.; Xu, A.; Narayanan, N. J. Biol. Chem. 1998, 273, 28032.
54. Dothager, R. S.; Putt, K. S.; Allen, B. J.; Leslie, B. J.; Nesterenko, V.; Hergenrother,
P. J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 8686.
55. Palchaudhuri, R.; Hergenrother, P. J. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 5888.
56. Benaka Prasad, S.; Vinaya, K.; Ananda Kumar, C.; Swarup, S.; Rangappa, K. Med.
Chem. Res. 2010, 19, 220.
10. Knight, S. D.; Parrish, C. A. Curr. Top. Med. Chem. 2008, 8, 888.
11. Zhang, Y.; Xu, W. Anticancer Agents Med. Chem. 2008, 8, 698.
12. Lawrence, C. J.; Dawe, R. K.; Christie, K. R.; Cleveland, D. W.; Dawson, S. C.;
Endow, S. A.; Goldstein, L. S.; Goodson, H. V.; Hirokawa, N.; Howard, J.;
Malmberg, R. L.; McIntosh, J. R.; Miki, H.; Mitchison, T. J.; Okada, Y.; Reddy, A.
S.; Saxton, W. M.; Schliwa, M.; Scholey, J. M.; Vale, R. D.; Walczak, C. E.;
Wordeman, L. J. Cell Biol. 2004, 167, 19.
13. Goshima, G.; Vale, R. D. J. Cell Biol. 2003, 162, 1003.
14. Blangy, A.; Lane, H. A.; d’Herin, P.; Harper, M.; Kress, M.; Nigg, E. A. Cell 1995,
83, 1159.
15. Mountain, V.; Simerly, C.; Howard, L.; Ando, A.; Schatten, G.; Compton, D. A. J.
Cell Biol. 1999, 147, 351.
16. Skoufias, D. A.; DeBonis, S.; Saoudi, Y.; Lebeau, L.; Crevel, I.; Cross, R.; Wade, R.
H.; Hackney, D.; Kozielski, F. J. Biol Chem. 2006, 281, 17559.
17. Haque, S. A.; Hasaka, T. P.; Brooks, A. D.; Lobanov, P. V.; Baas, P. W. Cell Motil.
Cytoskeleton 2004, 58, 10.
18. Mayer, T. U.; Kapoor, T. M.; Haggarty, S. J.; King, R. W.; Schreiber, S. L.;
Mitchison, T. J. Science 1999, 286, 971.
57. Shi, J.; Orth, J. D.; Mitchison, T. Cancer Res. 2008, 68, 3269.
58. Kantarjian, H. M.; Padmanabhan, S.; Stock, W.; Tallman, M. S.; Curt, G. A.; Li, J.;
Osmukhina, A.; Wu, K.; Huszar, D.; Borthukar, G.; Faderl, S.; Garcia-Manero, G.;
Kadia, T.; Sankhala, K.; Odenike, O.; Altman, J. K.; Minden, M. Invest New Drugs
59. Shimizu, M.; Ishii, H.; Ogo, N.; Unno, Y.; Matsuno, K.; Sawada, J.; Akiyama, Y.;
Asai, A. Cancer Lett. 2010, 298, 99.
60. Tunquist, B. J.; Woessner, R. D.; Walker, D. H. Mol. Cancer Ther. 2010, 9, 2046.
61. Carter, B. Z.; Mak, D. H.; Woessner, R.; Gross, S.; Schober, W. D.; Estrov, Z.;
Kantarjian, H.; Andreeff, M. Leukemia 2009, 23, 1755.
19. DeBonis, S.; Skoufias, D. A.; Lebeau, L.; Lopez, R.; Robin, G.; Margolis, R. L.;
Wade, R. H.; Kozielski, F. Mol. Cancer Ther. 2004, 3, 1079.
20. Zee-Cheng, K. Y.; Cheng, C. C. J. Med. Chem. 1970, 13, 414.
21. Tarby, C. M.; Kaltenbach, R. F., 3rd; Huynh, T.; Pudzianowski, A.; Shen, H.;
Ortega-Nanos, M.; Sheriff, S.; Newitt, J. A.; McDonnell, P. A.; Burford, N.;
Fairchild, C. R.; Vaccaro, W.; Chen, Z.; Borzilleri, R. M.; Naglich, J.; Lombardo, L.
J.; Gottardis, M.; Trainor, G. L.; Roussell, D. L. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16,
2095.
22. Cox, C. D.; Coleman, P. J.; Breslin, M. J.; Whitman, D. B.; Garbaccio, R. M.; Fraley,
M. E.; Buser, C. A.; Walsh, E. S.; Hamilton, K.; Schaber, M. D.; Lobell, R. B.; Tao,
W.; Davide, J. P.; Diehl, R. E.; Abrams, M. T.; South, V. J.; Huber, H. E.; Torrent,
M.; Prueksaritanont, T.; Li, C.; Slaughter, D. E.; Mahan, E.; Fernandez-Metzler,
C.; Yan, Y.; Kuo, L. C.; Kohl, N. E.; Hartman, G. D. J. Med. Chem. 2008, 51, 4239.
62. Peters, N. T.; Kropf, D. L. BMC Plant Biol. 2006, 6, 19.
63. George, O.; Bryant, B. K.; Chinnasamy, R.; Corona, C.; Arterburn, J. B.; Shuster, C.
B. ACS Chem. Biol. 2008, 3, 167.