Stammers, T.A.; Thauvette, L.; Thavonekham, B.; Kukolj, G. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010, 20, 857. (g)
Goulet, S.; Poupart, M.-A.; Poirier, M.; Gillard, J.; Kukolj, G.; Beaulieu P. L.; Bioorg. Med. Chem. Lett.
2010, 20, 196 and references therein.
9 For recent review on the different classes of HCV NS5B inhibitors see: (a) Sofia, M. J.; Chang, W.;
Furman, P. A.; Mosley, R. T.; Ross, B. S. J. Med. Chem. 2012, 55, 2481. (b) Li, H.; Shi, S. T. Future Med
Chem. 2010, 2, 121. (c) Legrand-Abravanel, F.; Nicot, F.; Izopet, J. Expert Opin. Investig. Drugs 2010,
19, 963. (d) Beaulieu, P.L. Expert Opin. Ther. Patents 2009, 19, 145.
10 (a) Llinás-Brunet, M.; Bailey, M. D.; Goudreau, N.; Bhardwaj, P. K.; Bordeleau, J.; Bös, M.; Bousquet,
Y.; White, P. W.; Cordingley, M. G.; Duan, J.; Forgione, P.; Garneau, M.; Ghiro, E.; Gorys, V.; Goulet, S.;
Halmos, T.; Kawai, S. H.; Naud, J.; Poupart, M.-A.; White, P. W.; J. Med. Chem. 2010, 53, 6466. (b)
White, P. W.; Llinas-Brunet, M.; Amad, M.; Bethell, R. C.; Bolger, G.; Cordingley, M. G.; Duan, J.;
Garneau, M.; Lagacé, L.; Thibeault, D.; Kukolj, G. Antimicrobial Agents and Chemotherapy 2010, 54,
4611. (c) Lemke, C. T.; Goudreau, N.; Zhao, S.; Hucke, O.; Thibeault, D.; Llinás-Brunet, M.; White, P. W.;
J. Biol. Chem. 2011, 286, 11434 and references therein.
11 References containing biochemical characterization and x-ray co-structures of representative
chemotypes that bind to thumb site 2: (a) Kumar, D. V.; Rai, R.; Brameld, K. A.; Somoza, J. R.;
Rajagopalan, R.; Janc, J. W.; Xia, Y. M.; Ton, T. L.; Shaghafi, M. B.; Hu, H.; Lehoux, I.; To, N.; Young, W.
B.; Green, M. J. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011, 21, 82. (b) Ontoria, J. M.; Rydberg, E.; H.; Di Marco, S.;
Tomei, L.; Attenni, B.; Malancona, S.; Hernando, J. I. M.; Gennari, N.; Koch, U.; Narjes, F.; Rowley, M.;
Summa, V.; Carroll, S. S.; Olsen, D.; De Francesco, R.; Altamura, S.; Migliaccio, G.; Carfi, A. J. Med.
Chem. 2009, 52, 5217. (c) Antonysamy, S. S.; Aubol, B.; Blaney, J.; Browner, M. F.; Giannetti, A. M.;
Harris, S. F.; Hébert, N.; Hendle, J.; Hopkins, S.; Jefferson, E.; Kissinger, C.; Leveque, V.; Marciano, D.;
McGee, E.; Nájera, I.; Nolan, B.; Tomimoto, M.; Torres, E.; Wright, T. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18,
2990. (d) Yan, S.; Appleby, T.; Larson, G.; Wu, J. Z.; Hamatake, R K.; Hong, Z.; Yao, N. Bioorg. Med.
Chem. Lett. 2007, 17, 1991. (e) Howe, A. Y. M.; Cheng, H.; Thompson, I.; Chunduru, S. K.; Herrmann, S.;
O’Connell J.; Agarwal, A.; Chopra, R.; Del Vecchio, A. M. Antimicrob. Agents and Chemother. 2006, 50,
4103. (f) Biswal, B. K.; Cherney, M. M.; Wang, M.; Chan, L.; Yannopoulos, C. G.; Bilimoria, D.; Nicolas,
O.; Bedard, J.; James, M. N. G. J. Biol. Chem. 2005, 280, 18202. (g) Wang, M.; Ng, K. K.-S.; Cherney, M.
M.; Chan, L.; Yannopoulos, C. G.; Bedard, J.; Morin, N.; Nguyen-Ba, N.; Alaoui-Ismaili, M. H.; Bethell, R.
C.; James, M. N. G. J. Biol. Chem. 2003, 278, 9489. (h) Love, R. A.; Parge, H. E.; Yu, X.; Hickey, M. J.;
Diehl, W,; Gao, J.; Wriggers, H.; Ekker, A.; Wang, L.; Thomson, J. A.; Dragovich, P. S.; Fuhrman, S. A. J.
Virol. 2003, 77, 7575.
12 Gopalsamy, A.; Lim, K.; Ciszewski, G.; Park, K.; Ellingboe, J. W.; Bloom, J.; Insaf, S.; Upeslacis, J.;
Mansour, T. S.; Krishnamurthy, G.; Damarla, M.; Pyatski, Y.; Ho, D.; Howe, A. Y. M.; Orlowski, M.; Feld,
B.; O’Connell, J. J. Med. Chem. 2004, 47, 6603.
13 Chan, L.; Das, S. K.; Reddy, T. J.; Poisson, C.; Proulx, M.; Pereira, O.; Courchesne, M.; Roy, C.;
Wang, W.; Siddiqui, A.; Yannopoulos, C. G.; Nguyen-Ba, N.; Labrecque, D.; Bethell, R.; Hamel, M.;
Courtmanche-Asselin, P.; L’Heureux, L.; David, M.; Nicolas, O.; Brunette, S.; Bilimoria, D.; Bédard, J.
Bioorg. & Med. Chem. Lett. 2004, 14, 793.
14 Tomei, L.; Altamura, S.; Bartholomew, L.; Biroccio, A.; Ceccacci, A.; Pacini, L.; Narjes, F.; Gennari, N.;
Biscocci, M.; Incitti, I.; Orsatti, L.; Harper, S.; Stansfield, I.; Rowley, M.; De Francesco, R.; Migliaccio, G.
J. Virol. 2003, 77, 13225.
15 Kukolj, G.; McGibbon, G. A.; McKercher, G.; Marquis, M.; Lefebvre, S.; Thauvette, L.; Gauthier, J.;
Goulet, S.; Poupart, M.-A.; Beaulieu, P. L. J. Biol. Chem. 2005, 280, 39260.
16 Le Pogam, S.; Kang, H.; Harris, S. F.; Leveque, V.; Giannetti, A. M.; Ali, S.; Jiang, W.-R.; Rajyaguru,
S.; Tavares, G.; Oshiro, C.; Hendricks, T.; Klumpp, K.; Symons, J.; J.; Browner, M. F.; Cammack, N.;
Najera, I.; J. Virol. 2006, 80, 6146.
17 Shi, S. T.; Herlihy, K. J.; Graham, J. P.; Nonomiya, J.; Rahavendran, S. V.; Skor, H.; Irvine, R.; Binford,
S.; Tatlock, J.; Li, H.; Gonzalez, J.; Linton, A.; Patrick, A. K.; Lewis, C. Antimicrob. Agents and
Chemother. 2009, 53, 2544.
18 Nguyen, T. T.; Gates, A. T.; Gutshall, L. L.; Johnston, V. K.; Gu, B.; Duffy, K. J.; Sarisky, R. T.
Antimicrob. Agents and Chemother. 2003, 47, 3525.
19 Troke, P. J. F.; Lewis, M.; Simpson, P.; Gore, K.; Hammond, J.; Craig, C.; Westby, M. Antimicrob.
Agents and Chemother. 2012, 56, 1331.
10