13
ACCEPTED MANUSCRIPT
2. Direct amidation of unactivated carboxylic acids: Lundberg, H.;
Tinnis, F.; Selander, N.; Adolfsson, H. Chem. Soc. Rev. 2014,
43, 2714−2742.
3. Amide bond formation and peptide coupling, using coupling
reagents: a) Valeur, E.; Bradley, M. Chem. Soc. Rev. 2009, 38,
606−631. b) Montalbetti, C. A. G. N.; Falque, V. Tetrahedron
2005, 61, 10827–10852. c) Han, S.-Y.; Kim, Y.-A. Tetrahedron
2004, 60, 2447−2467.
4. Short accounts: a) Piazzolla, F.; Temperini, A. Tetrahedron Lett.
2018, 59, 2615-2621. b) Ojeda-Porras, A.; Gamba-Sánchez, D.
J. Org. Chem. 2016, 81, 11548−11555. c) Allen, C. L.;
Williams, M. J. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 3405−3415.
5. a) Emerging methods for amide bond formation and novel
ligation strategies for peptide and polyamide synthesis: Bode,
Top. Organomet. Chem. 2013, 44, 13−34. b) Pattabiraman, V.
R.; Bode, J. W. Nature 2011, 480, 471−479.
Grenon, M. Can. J. Chem. 2001, 79, 1694−1703. e) Charette, A.
B.; Grenon, M.; Lemire, A.; Pourashraf, M.; Martel, J. J. Am.
Chem. Soc. 2001, 123, 11829−11830. f) Pelletier, G.; Bechara,
W. S.; Charette, A. B. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132,
12817−12819. g) Bechara, W.; Pelletier, G.; Charette, A. B.
Nature Chem. 2012, 4, 228−234.
24. Selected references: a) Movassaghi, M.; Hill, M. D. J. Am.
Chem. Soc. 2006, 128, 14254-14255. b) Ahmad, O. K.; Hill, M.
D.; Movassaghi, M. J. Org. Chem. 2009, 74, 8460-8463. c)
Stopka, T.; Adler, P. Hagn, G.; Zhang, H. Tona, V.; Maulide, N.
Synthesis 2019, 51, 194-202.
25. Sisti, N, J.; Motorina, I. A.; Tran Huu Dau, M.-E.; Riche, C.;
Fowler, F. W.; Grierson D. S. J. Org. Chem. 1996, 61,
3715−3728.
26. Falmagne, J.-B.; Escudero, J.; Taleb-Sahraoui, S.; Ghosez, L.
Angew. Chem. 1981, 93, 926-931; Angew. Chem. Int. Ed. Engl.
1981, 20, 879−880.
6. a) Roughley, S. D.; Jordan, A. M. J. Med. Chem. 2011, 54,
3451–3479. b) Brown, D. G.; Boström, J. J. Med. Chem. 2016,
59, 4443−4458.
27. Charette, A. B.; Mathieu, S.; Martel, J. Org. Lett. 2005
, 7,
5401 5404.
−
7. Lanigan, R. M.; Sheppard, T. D. Eur. J. Org. Chem. 2013,
28. a) Szostak, R.; Shi, S.; Meng, G.; Lalancette, R.; Szostak, M. J.
Org. Chem. 2016, 81, 8091−8094. b) Meng, G.; Shi, S.;
Lalancette, R.; Szostak, R.; Szostak, M. J. Am. Chem. Soc. 2018,
140, 727−734. c) Microreview on “twisted amides”: Liu, C.;
Szostak, M. Chem. Eur. J. 2017, 23, 7157−7173.
29. Winkler, F. K.; Dunitz, J. D. J. Mol. Biol. 1971, 59, 169−182.
30. Comprehensive reviews: a) Cavallo, G.; Metrangolo, P. Milani,,
R.; Pilati, T.; Priimagi, A.; Resnati G.; Terraneo, G. Chem. Rev.
2016, 116, 2478−2601. b) Metrangolo, P.; Resnati, G. (eds.).
Halogen Bonding: Fundamentals and Applications, Springer,
Berlin, 2008.
31. Selected publications on the nature of the halogen bond: a)
Costa, P. J. Phys. Sc. Rev. 2017, 2(11), 20170136; De Gruyter,
0136. b) Politzer, P.; Murray, J. S.; Clark, T. Phys. Chem. Chem.
Phys. 2010, 12, 7748−7757. c) Murray J. S.; Riley, K. E.;
Politzer, P.; Clark, T. Austr. J. Chem. 2010, 63, 1598−1607.
32. a) Selected publications on crystal architectures: a) Troff, R. W.;
Mäkelä, T.; Topić, F.; Valkonen, A.; Raatikainen, K.; Rissanen,
K. Eur. J. Org. Chem. 2013, 1617−1637. b) Rissanen, K.;
CrystEngComm 2008, 10, 1107−1113. c) Cavallo, G.;
Metrangolo, P.; Pilati, T.; Resnati, G.; Sansotera, M.; Terraneo,
G. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 3772−3783.
7453−7465.
8. Guzmán, P. A.; Mateus-Gómez, A.; Gamba-Sánchez, D.
Molecules 2018, 23, 2382.
9. a) Nguyen, T. B.; Sorres, J.; Tran, M. Q.; Ermolenko, A.; Al-
Mourabi, A. Org. Lett. 2012, 14, 3202−3205. b) Zhang, M.;
Imm, S.; Bähn, S.; Neubert, L.; Neumann, H.; Beller, M. Angew.
Chem. Int. Ed. 2012, 51, 3905−3909. c) Becerra-Figueroa, L.;
Ojeda-Porras, A.; Gamba-Sánchez, D. J. Org. Chem. 2014, 79,
4544−4552. d) Baker, E. L.; Yamano, M. M.; Zhou, Y. J.;
Antony, S. M.; Garg, N. K. Nat. Commun. 2016, 7, 11554. e)
Dander, J. E.; Baker, E. L.; Garg, N. K. Chem. Sci. 2017, 8,
6433−6438. f) Meng, G.; Lei, P.; Szostak, M. Org. Lett. 2017,
19, 2158−2161. g) Shi, S.; Szostak, M. Chem. Commun. 2017,
53, 10584−10587.
10. Yin, J.; Zhang, J.; Cai, C.; Deng, G.-J.; Gong, H. Org. Lett.
2019, 21, 387−392.
11. a) Liu, Y.; Shi, S.; Achtenhagen, M.; Liu, R.; Szostak, M. Org.
Lett. 2017, 19, 1614−1617. b) Li, G.; Szostak, M. Nature
Commun. 2018, 9, 4165. c) Meng, G.; Shi, S.; Lalancette, R.;
Szostak, R.; Szostak, M. J. Am. Chem. Soc. 2018, 140, 727−734.
12. a) Verho, O.; Lati, M. P., Oschmann, M. J. Org. Chem. 2018, 83,
3364−4476. b) N-Boc amides with Ni(II) catalysis: lit. 9e.
13. a) Kondo, K.; Sekimoto, E.; Nakao, J.; Murakami, Y.
Tetrahedron 2000, 56, 5843−5856. b) Coniglio, S.; Aramini, A.;
Cesta, M. C.; Colagioia, S.; Curti, R.; D’Alessandro, F.;
D’Anniballe, G.; D’Elia, V.; Nano, G.; Orlando, V.; Allegretti,
M. Tetrahedron Lett. 2004, 45, 5375−5378.
33. Kratzer, P.; Ramming, B.; Römisch, S.; Maas, G.
CrystEngComm 2015, 17, 4486−4494.
34. Baillargeon, P.; Rahem, T.; Caron-Duval, É.; Tremblay, J.;
Fortin, C.; Blais, E.; Fan, V.; Fortin, D.; Dory, Y. L. Acta Cryst.
2017, E73, 1175−1179.
14. Ebrahimi, S.; Saiadi, S.; Dakhilpour, S.; Mirsattari, S. N.;
35. Alfonsi, K.; Colberg, J.; Dunn, P. J.; Fevig, T.; Jennings, S.;
Johnson, T. A.; Kleine, H. P.; Knight, C.; Nagy, M. A.; Perry, D.
A.; Stefaniak, M. Green Chem. 2008, 10, 31−36.
Massah, A. R. Z. Naturforsch. 2016, 71b, 95−104.
15. a) Hendrickson, J. B.; Bergeron, R. Tetrahedron Lett. 1973, 46,
4607−4610. b) Guillard, S.; Aramini, A.; Cesta, M. C.;
Colagioia, S.; Coniglio, S.; Genovese, F.; Nano, G.; Nuzzo, E.;
Orlando, V.; Allegretti, M. Tetrahedron 2006, 62, 5608−5616.
16. a) Yanada, R.; Obika, S.; Kobayashi, Y.; Inokuma, T.; Oyama,
M.; Yanada, K.; Takemoto, Y. Adv. Synth. Catal. 2005, 347,
1632-1642. b) D’Souza, D. M.; Kiel, A.; Herten, D.-P.;
Rominger F.; Müller, T. J. J. Chem. Eur. J. 2008, 14, 529−547.
17. Andreev, M. V.; Safronova, L. P.; Medvedeva, A. S. Russ. J.
Org. Chem. 2012, 47, 1797−1801.
36. Al-Jallo, H. N. Tetrahedron Lett. 1970, 875−876.
37. a) Walter, W.; Reubke, K.-J. Chem. Ber. 1970, 103, 2197−2207.
b) Bouchet, P.; Elguero, J.; Jacquier, R.; Pereillo, J.-M. Bull.
Soc. Chim. Fr. 1972, 2264−2271. c) Gusev, V. Y.; Batueva, T.
D.; Feshin, V. P.;Nasrtdinova, T. Y.; Radushev, A. V.;
Maiorova, O. A.; Karmanov, V. I. Russ J. Gen. Chem. 2009, 79,
2354−2358.
38. a) Katritzky, A. R.; Maine, F. W. Tetrahedron 1964, 20,
315−322. b) O-Brien, D. F.; Gates, Jr., J. W. J. Org. Chem.
1966, 31, 1538−1542.
39. Arbačiauskienė, E.; Krikštolaitytė, S.; Mitrulevičienė, A.;
Bieliauskas, A.; Martynaitis, V.; Bechmann, M.; Roller, A.;
Šačkus, A.; Holzer, W. Molecules 2018, 23, 129.
40. Review: Sucrow, W. Org. Prep. Proc. Intern. 1982, 14, 91−155.
41. Hamper, B. C.; Kurtzweil, M. L.; Beck, J. P. J. Org. Chem.
1992, 57, 5680−5686.
18. a) Coppola, G.; Damon, R. E. Synth. Commun. 1993, 23, 2003-
2010. b) Coppola, G. M.; Damon, R. E. J. Heterocycl. Chem.
1995, 32, 1133−1139.
19. Katritzky, A. R.; Zhang, Y.; Singh, S. K.; Steel, P. J. ARKIVOC
2003 (xv), 47−64.
20. Rooke, D. A.; Ferreira, E. M. Angew Chem. 2012, 3279−3284;
Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 3225-3230.
42. Nakamura, N.; Kishida, Y.; Ishida, N. Chem. Pharm. Bull. 1971,
21. Rodriguez, S.; Navarro-Vázquez, A.; Castedo, L.; Dominguez,
D.; Saá, C. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9178−9179.
22. Sisti, N. J.; Zeller, E.; Grierson, D. S.; Fowler, F. W. J. Org.
Chem. 1997, 62, 2093−2097.
23. Selected references: a) Charette, A. B.; Chua, P. Tetrahedron
Lett. 1998, 39, 245-248. b) Charette, A. B.; Chua, P., J. Org.
Chem. 1998, 63, 908−909. c) Charette A. B.; Grenon, M.
Tetrahedron Lett. 2000, 41, 1677−1680. d) Charette, A. B.;
19, 1389−1394.
43. Sheldrick, G. M. Acta Crystallogr. 2008, A64, 112−122.
44. Sheldrick, G. M. Acta Crystallogr. 2015, C71, 3−8.
45. Farrugia, L. J. J. Appl. Crystallogr. 2012, 45, 849−854.