Organic & Biomolecular Chemistry
Paper
8 H. Imamura, K. P. Huynh Nhat, H. Togawa, K. Saito, 28 A. Martinez-Peragon, D. Miguel, R. Jurado, J. Justicia,
R. Iino, Y. Kato-Yamada, T. Nagai and H. Noji, Proc. Natl.
Acad. Sci. U. S. A., 2009, 106, 15651–15656.
J. M. Alvarez-Pez, J. M. Cuerva and L. Crovetto, Chem. – Eur.
J., 2014, 20, 447–455.
9 M. Ito, S. Haito, M. Furumoto, Y. Uehata, A. Sakurai, 29 H. Sudo, H. A. Kodama, Y. Amagai, S. Yamamoto and
H. Segawa, S. Tatsumi, M. Kuwahata and K.-i. Miyamoto,
Am. J. Physiol., 2007, 292, C526–C534.
10 M. R. Ganjali, M. Hosseini, Z. Memari, F. Faridbod,
S. Kasai, J. Cell Biol., 1983, 96, 191–198.
30 M. D. Giron, C. M. Havel and J. A. Watson, Proc. Natl. Acad.
Sci. U. S. A., 1994, 91, 6398–6402.
P. Norouzi, H. Goldooz and A. Badiei, Anal. Chim. Acta, 31 J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy,
2011, 708, 107–110. Springer, 3rd edn, 2006.
11 J. M. Paredes, M. D. Giron, M. J. Ruedas-Rama, A. Orte, 32 S. E. Braslavsky, A. U. Acuna, W. Adam, F. Amat,
L. Crovetto, E. M. Talavera, R. Salto and J. M. Alvarez-Pez,
J. Phys. Chem. B, 2013, 117, 8143–8149.
12 J. Yguerabide, E. Talavera, J. M. Alvarez and B. Quintero,
Photochem. Photobiol., 1994, 60, 435–441.
13 J. M. Alvarez-Pez, L. Ballesteros, E. Talavera and
J. Yguerabide, J. Phys. Chem. A, 2001, 105, 6320–6332.
14 N. Boens, W. Qin, N. Basaric, A. Orte, E. M. Talavera and
J. M. Alvarez-Pez, J. Phys. Chem. A, 2006, 110, 9334–9343.
15 J. Widengren, V. Kudryavtsev, M. Antonik, S. Berger,
M. Gerken and C. A. M. Seidel, Anal. Chem., 2006, 78,
2039–2050.
D. Armesto, T. D. Z. Atvars, A. Bard, E. Bill, L. O. Bjoern,
C. Bohne, J. Bolton, R. Bonneau, H. Bouas-Laurent,
A. M. Braun, R. Dale, K. Dill, D. Doepp, H. Duerr,
M. A. Fox, T. Gandolfi, Z. R. Grabowski, A. Griesbeck,
A. Kutateladze, M. Litter, J. Lorimer, J. Mattay, J. Michl,
R. J. D. Miller, L. Moggi, S. Monti, S. Nonell, P. Ogilby,
G. Olbrich, E. Oliveros, M. Olivucci, G. Orellana,
V. Prokorenko, K. R. Naqvi, W. Rettig, A. Rizzi, R. A. Rossi,
E. San Roman, F. Scandola, S. Schneider, E. W. Thulstrup,
B. Valeur, J. Verhoeven, J. Warman, R. Weiss, J. Wirz and
K. Zachariasse, Pure Appl. Chem., 2007, 79, 293–465.
16 T. Miura, Y. Urano, K. Tanaka, T. Nagano, K. Ohkubo and 33 M. Maus, M. Cotlet, J. Hofkens, T. Gensch, S. F. C. De,
S. Fukuzumi, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 8666–8671.
J. Schaffer and C. A. Seidel, Anal. Chem., 2001, 73, 2078–
17 T. Ueno, Y. Urano, K. Setsukinai, H. Takakusa, H. Kojima,
2086.
K. Kikuchi, K. Ohkubo, S. Fukuzumi and T. Nagano, J. Am. 34 C. Hansch, A. Leo and R. W. Taft, Chem. Rev., 1991, 91,
Chem. Soc., 2004, 126, 14079–14085. 165–195.
18 T. Mineno, T. Ueno, Y. Urano, H. Kojima and T. Nagano, 35 K. S. Alongi and G. C. Shields, in Annual Reports in Compu-
Org. Lett., 2006, 8, 5963–5966.
19 R. Zhou and T. Ha, Methods Mol. Biol., 2012, 922, 85–100.
tational Chemistry, ed. A. W. Ralph, Elsevier, 2010, vol. 6,
pp. 113–138.
20 Y. Urano, M. Kamiya, K. Kanda, T. Ueno, K. Hirose and 36 K. C. Gross and P. G. Seybold, Int. J. Quantum Chem., 2001,
T. Nagano, J. Am. Chem. Soc., 2005, 127, 4888–4894. 85, 569–579.
21 J. M. Paredes, L. Crovetto, R. Rios, A. Orte, J. M. Alvarez-Pez 37 Structures 3 and 4 showed the same trend (8.16 and 7.74 kJ
and E. M. Talavera, Phys. Chem. Chem. Phys., 2009, 11,
5400–5407.
22 L. Crovetto, J. M. Paredes, R. Rios, E. M. Talavera and
J. M. Alvarez-Pez, J. Phys. Chem. A, 2007, 111, 13311–
13320.
23 J. M. Paredes, A. Garzon, L. Crovetto, A. Orte, S. G. Lopez
and J. M. Alvarez-Pez, Phys. Chem. Chem. Phys., 2012, 14,
5795–5800.
24 C. R. Schroeder, B. M. Weidgans and I. Klimant, Analyst,
2005, 130, 907–916.
mol−1 respectively). Nevertheless, for compound 2 the
calculated free energies for structures around the minimum
of energy oscillated up to 3 kJ mol−1, avoiding a reliable
comparison with the other values.
38 In this case, the torsion angle in the minimum energy
structure is about 66°. When we artificially force the angle
to 90° the situation is clearer and the proton transfer
energy is only 1.04 kJ mol−1 with respect to 2-Me-4-OMe
TG.
39 T. Nagano, Proc. Jpn. Acad., B, 2010, 86, 837–847.
25 A. M. Paradiso, R. Y. Tsien and T. E. Machen, Proc. Natl. 40 E. Cielen, A. Tahri, K. Ver Heyen, G. J. Hoornaert, F. C. De
Acad. Sci. U. S. A., 1984, 81, 7436–7440.
Schryver and N. Boens, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1998,
1573–1580.
41 E. Cielen, A. Stobiecka, A. Tahri, G. J. Hoornaert, F. C. De
Schryver, J. Gallay, M. Vincent and N. Boens, J. Chem. Soc.,
Perkin Trans. 2, 2002, 1197–1206.
26 M. L. Graber, D. C. DiLillo, B. L. Friedman and
E. Pastoriza-Munoz, Anal. Biochem., 1986, 156, 202–212.
27 L. D. Lavis, T. J. Rutkoski and R. T. Raines, Anal. Chem.,
2007, 79, 6775–6782.
This journal is © The Royal Society of Chemistry 2014
Org. Biomol. Chem., 2014, 12, 6432–6439 | 6439